2010年,世界各地渐渐接受了被选召的孩子们的存在,在现实世界见到数码兽的光景也变得稀松平常。八神太一(22岁)与石田大和(22岁)身为即将毕业的大学生,对自己的前途感到迷茫,而其他伙伴们都各自确立了今后的志向,朝着自己未来目标向前迈进。
就在此时,在全世界各地被选召的孩子们出现失去意识的情况,某起事件开始蠢蠢欲动。专门研究数码兽的美国学者梅诺亚·贝鲁奇与助手井村京太郎出现在太一他们的面前,并声称名为“厄俄斯兽”(Eosmon)的数码兽就是元凶,希望太一他们能协助自己。为了解决事件,太一他们这些被选召的孩子们再度集结……
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